de Appel arts centre onderhoudt langlopende samenwerkingsverbanden met:

Comite van Roosendaal
Frascati
Universiteit van Amsterdam
Witte de With center for Contemporary Art

Daarnaast heeft de Appel samenwerkingsverbanden met:

Amsterdam School of Cultural Analysis
Stedelijk Museum Amsterdam
Jan Mot Gallery - Brussel
GB Agency - Parijs
Raster - Warshaw
Hollybush Gardens - Londen
Liste - The Young Artfair - Basel

De Appel arts centre is onderdeel van het samenwerkingsproject de Plantage Amsterdam: De Plantage Amsterdam is een samenwerkingsverband tussen zestien culturele instellingen in de oostelijke binnenstad. Talrijke musea, roemrijke theaters, lommerrijke parken en een keur aan cafés en restaurants maken de Plantage de mooiste buurt van Amsterdam. www.deplantageamsterdam.nl/

LIMA 
Rijksakademie
Stedelijk Museum Amsterdam  

En is aangesloten bij:
OKBN Overleg Kunst(historische) Bibliotheken Nederland
Adamnet